Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms