Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM5BQ9UGL1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms