Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REV1Q9UBZ9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms