Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS29Q9UBQ0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms