Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms