Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms