Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms