Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms