Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATAD3AQ9NVI7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms