Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMBRD1Q9NUN5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms