Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC4BQ9NT99 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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