Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTG1Q9NSN8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms