Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms