Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX9Q9NQ69 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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