Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms