Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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