Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZCCHC17Q9NP64 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms