Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms