Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPJQ9HC77 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms