Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELL3Q9HB65 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms