Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COMMD5Q9GZQ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COMMD5Q9GZQ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms