Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms