Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP44Q9C0F1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms