Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXQ1Q9C009 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms