Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms