Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms