Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RSPO3Q9BXY4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms