Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DPCDQ9BVM2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms