Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms