Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TIMM29Q9BSF4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms