Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms