Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms