Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A2Q96QD8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms