Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFXN2Q96NB2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms