Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms