Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC35A4Q96G79 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC35A4Q96G79 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms