Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms