Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
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