Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF1Q92879 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms