Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FAT3Q8TDW7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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