Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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