Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms