Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms