Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMBOX1Q6NT76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms