Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SAMD13Q5VXD3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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