Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms