Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms