Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms