Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA8Q53HL2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms