Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms